В 1885 году в деревне Нискасы в арендуемом крестьянском доме начала работать церковно-приходская школа. В 1906 году построено здание земского училища, где была открыта начальная школа с четырехгодичным обучением. В 1923-1924 учебном году – 2-комплектная школа 1 ступени, работали 2 учителя. В 1932 году преобразована в школу крестьянской молодежи с 7-летним сроком обучения.

В 1981 году построено новое типовое трехэтажное здание, школа перешла на кабинетную систему образования.

Нискасинская средняя общеобразовательная школа занимает призовые места в республиканских и районных конкурсах. В 2004 году в республиканском конкурсе «Школа года» в номинации «Школа здоровья» заняла второе место, в этом году – третье место по благоустройству и озеленению школы.